がんゲノムデータ解析

学生,院生,研究者,医師,臨床検査技師・・・

がんの解析を始めたいすべての人へ

最初の一歩をこの本から!




がんゲノム医療において不可欠な、がんゲノムのデータを解析する知識と技術が身につく、実践に即した解説書。各章とも「教科書パート」(教師役が執筆)でソフトウェアのインストールから解析データの取得、データ解析、そして結果の可視化までを学び、「再現・検証レポート」(生徒役が執筆)で実際に解析を体験。つまずいた箇所は「教科書パート」にフィードバックし再確認できる、初学者の独学に効果的な学習形式を採用。データ解析未経験者でもよくわかる必携書。



■本書のコマンドをGitHubに掲載しています



GitHubの『がんゲノムデータ解析』レポジトリ(外部サイト)



■「第2章 がんのターゲットリシークエンシング」ハンズオンセミナー(2022年7月2日収録)

がんゲノム医療の検査(Wet)工程 セミナー動画 講師:柳田絵美衣(外部サイト)

*【20:33】DANと書いてしまっていますが,DNAです。



がん遺伝子パネル検査バイオインフォマティクス解析 セミナー動画その1 講師:谷嶋成樹(外部サイト)



がん遺伝子パネル検査バイオインフォマティクス解析 セミナー動画その2<講師:谷嶋成樹(外部サイト)

*動画で紹介しているのは本書制作途中の校正刷です。最終的な内容は本書をご覧ください。

¥6,600 税込
編集:清水厚志(岩手医科大学医歯薬総合研究所生体情報解析部門)・坊農秀雅(広島大学大学院統合生命科学研究科ゲノム情報科学研究室)
ISBN
978-4-8157-3052-9
判型/ページ数/図・写真
B5変 頁472 図159
刊行年月
2022年8月
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第1章 がんのゲノム・オミックス解析を視野に入れた検体保存方法
COLUMN 1 がんゲノム研究と倫理的・法的・社会的課題
第2章 がんのターゲットリシークエンス
―がんパネルシークエンスによる乳がん変異検出
再現・検証 とある検査技師のブラックボックスへの挑戦録
再現・検証 DRY解析初心者遺伝カウンセラーの挑戦
特別寄稿 遺伝カウンセラーが「がん患者」になるとき
COLUMN 2 がんゲノムプロファイリング検査におけるエキスパートパネルの概要と課題
COLUMN 3 がん遺伝子パネル検査の課題 ①医師の立場として 
COLUMN 4 がん遺伝子パネル検査の課題 ②臨床検査会社として
第3章 がんの融合遺伝子検出
―RNAシークエンスによるがん融合遺伝子検出
再現・検証 Macか,Windowsか,それが問題だ
第4章 がんのCNV検出
―SNPアレイによる転移性肝がん,およびメラノーマのコピー数変異検出 
再現・検証 中年も,大志を抱け―Linuxを扱うべきか扱わないべきかそれが問題だ 
第5章 がんのゲノム解析
―ロングリードシークエンサーによる肺がんゲノム構造変異検出 
再現・検証 遺伝子解析? それ美味しいの? 完全門外漢によるはじめての遺伝子解析 
COLUMN 5 完全ヒトゲノム配列ががんゲノム解析にもたらす恩恵
第6章 がんのGWAS
―GWASによる乳がん感受性多型の検出
再現・検証 世界で一番スマートなGWAS体験をあなたへ
第7章 がんのポリジェニックリスクスコア
―ゲノムデータから乳がんリスクスコアを計算
再現・検証 Mac初心者にもできる!できると楽しい!PRSの再現・検証 
COLUMN 6 がん環境要因の疫学研究と分子疫学
第8章 がんのエピゲノム解析
―マイクロアレイによる腎がんエピゲノム変異検出
再現・検証 R(ほぼ)初心者,EWASに挑戦―驚愕!?メチル化データによる性別推定の有用性と謎
第9章 がんのcfDNA解析
―リキッドバイオプシーによる大腸がん変異検出
再現・検証 「血の一滴」はどれだけ「重い」―cfDNAで読みとく運命の行方 
COLUMN 7 がんワクチン臨床試験の統計学的課題

脳科学を網羅する教科書

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