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がんゲノムデータ解析

学生，院生，研究者，医師，臨床検査技師・・・

がんの解析を始めたいすべての人へ

最初の一歩をこの本から！

がんゲノム医療において不可欠な、がんゲノムのデータを解析する知識と技術が身につく、実践に即した解説書。各章とも「教科書パート」（教師役が執筆）でソフトウェアのインストールから解析データの取得、データ解析、そして結果の可視化までを学び、「再現・検証レポート」（生徒役が執筆）で実際に解析を体験。つまずいた箇所は「教科書パート」にフィードバックし再確認できる、初学者の独学に効果的な学習形式を採用。データ解析未経験者でもよくわかる必携書。

■本書のコマンドをGitHubに掲載しています

GitHubの『がんゲノムデータ解析』レポジトリ（外部サイト）

■「第2章がんのターゲットリシークエンシング」ハンズオンセミナー（2022年7月2日収録）

がんゲノム医療の検査（Wet）工程セミナー動画講師：柳田絵美衣（外部サイト）

＊【20:33】DANと書いてしまっていますが，DNAです。

がん遺伝子パネル検査バイオインフォマティクス解析セミナー動画その1 講師：谷嶋成樹（外部サイト）

がん遺伝子パネル検査バイオインフォマティクス解析セミナー動画その2<講師：谷嶋成樹（外部サイト）

＊動画で紹介しているのは本書制作途中の校正刷です。最終的な内容は本書をご覧ください。

￥6,600 税込

著

編集：清水厚志（岩手医科大学医歯薬総合研究所生体情報解析部門）・坊農秀雅（広島大学大学院統合生命科学研究科ゲノム情報科学研究室）

ISBN

978-4-8157-3052-9

判型/ページ数/図･写真

B5変　頁472　図159

刊行年月

2022年8月

数量

第1章がんのゲノム・オミックス解析を視野に入れた検体保存方法
COLUMN 1　がんゲノム研究と倫理的・法的・社会的課題
第2章がんのターゲットリシークエンス
―がんパネルシークエンスによる乳がん変異検出
再現・検証　とある検査技師のブラックボックスへの挑戦録
再現・検証　DRY解析初心者遺伝カウンセラーの挑戦
特別寄稿　遺伝カウンセラーが「がん患者」になるとき
COLUMN 2　がんゲノムプロファイリング検査におけるエキスパートパネルの概要と課題
COLUMN 3　がん遺伝子パネル検査の課題 ①医師の立場として　
COLUMN 4　がん遺伝子パネル検査の課題 ②臨床検査会社として
第3章がんの融合遺伝子検出
―RNAシークエンスによるがん融合遺伝子検出
再現・検証　Macか，Windowsか，それが問題だ
第4章がんのCNV検出
―SNPアレイによる転移性肝がん，およびメラノーマのコピー数変異検出　
再現・検証　中年も，大志を抱け―Linuxを扱うべきか扱わないべきかそれが問題だ　
第5章がんのゲノム解析
―ロングリードシークエンサーによる肺がんゲノム構造変異検出　
再現・検証　遺伝子解析？　それ美味しいの？　完全門外漢によるはじめての遺伝子解析　
COLUMN 5　完全ヒトゲノム配列ががんゲノム解析にもたらす恩恵
第6章がんのGWAS
―GWASによる乳がん感受性多型の検出
再現・検証　世界で一番スマートなGWAS体験をあなたへ
第7章がんのポリジェニックリスクスコア
―ゲノムデータから乳がんリスクスコアを計算
再現・検証　Mac初心者にもできる！できると楽しい！PRSの再現・検証　
COLUMN 6　がん環境要因の疫学研究と分子疫学
第8章　がんのエピゲノム解析
―マイクロアレイによる腎がんエピゲノム変異検出
再現・検証　R（ほぼ）初心者，EWASに挑戦―驚愕!?メチル化データによる性別推定の有用性と謎
第9章　がんのcfDNA解析
―リキッドバイオプシーによる大腸がん変異検出
再現・検証　「血の一滴」はどれだけ「重い」―cfDNAで読みとく運命の行方　
COLUMN 7　がんワクチン臨床試験の統計学的課題